По территории парка протекает река Мрас-Су, левый приток Томи. Сплав по Мрас-Су — один из лучших способов познакомиться с красотами заповедной природы и Горной Шории. На живописных берегах реки оборудовано множество стоянок для отдыха, а по пути можно увидеть много интересных достопримечательностей.
