После удачного похода на Казань Иван Грозный решил поставить несколько храмов во имя Святого Сергия Радонежского, один из них ― в недавно основанном Алатыре. В XVIII веке во время строительства собора обитель обрела мощи старца Вассиана ― к ним за исцелением потянулись паломники. В советское время в упраздненной обители размещался штаб НКВД. В 1990-е стали восстанавливать храмы монастыря, вернулись чудотворные иконы ― Спаса Нерукотворного и Божьей Матери Казанской.
