В татарской слободе, которая располагалась между Иртышом и Знаменской улицей первый деревянный храм построили в 1752 году ― пустующий участок земли выкупил крестьянин Михаил Мухин и подарил митрополиту Тобольскому и Сибирскому Сильвестру. Через несколько лет в пожаре погибла не только церковь, но и другие слободские постройки. Почти два десятка лет строили новую ― в стиле сибирского барокко, торжественную, праздничную. В церкви Захарии и Елизаветы особо почитаемой считалась икона Богородицы «Всех скорбящих радость», которая исцеляла от болезней и оберегала от гибели.