Музей посвящен многообразию флоры и фауны Костромского края. Реалистичные диорамы, чучела и другие объекты знакомят посетителей с растительным и животным миром местности. Отдел природы расположился в историческом здании. Это бывшая коммерческая биржа и чайная — памятник архитектуры конца XIX века. Кроме экспозиции, охватывающей период с доисторических времен до современности, в музее можно познакомиться с заповедными территориями Костромской области и богатой коллекцией насекомых.