Экспозиция знакомит с историей развития фармацевтики, производства лекарственных препаратов и аптечного дела в России со времен Петра I до наших дней. Музей - это старейшая аптека Петербурга, основанная в 1770 году. Коллекцию составляют более трехсот экспонатов — медицинские инструменты и аппараты разных эпох, химическая утварь, старинные лекарства в гербовых флаконах. В подвальном помещении находится алхимическая лаборатория, в которой Василий Пель и Дмитрий Менделеев проводили совместные опыты, и настоящее бомбоубежище времен Великой Отечественной войны. В музее регулярно проводятся обзорные и тематические экскурсии, а также мастер-классы для детей.
