Обитель основана великим подвижником — преподобным Антонием Дымским в 1243 году. Монастырь является одним из древнейших в России. За многовековую историю он несколько раз разрушался: в 1409 году — татарами, в 1611 году — шведами. В 1919 году он был закрыт, а после — уничтожен и разорен. В начале 2000-х годов жизнь в обители стала восстанавливаться: возобновилась богослужебная и началась хозяйственная жизнь, были вновь обретены святые мощи преподобного Антония Дымского. В 2008 году монастырь был утвержден Священным Синодом.