Обитель основали в 1616 году в память об освобождении от поляков в период Смутного времени. В 1612 году, когда народное ополчение Кузьмы Минина и Дмитрия Пожарского шло через город, вспыхнула эпидемия. Воины и горожане молились у иконы Спаса Нерукотворного в часовне в Пробоинском переулке. В итоге болезнь прекратилась. Было принято решение о постройке на этом месте монастыря. В 1616‒1628 годах возведены деревянные церкви в честь иконы Спаса Нерукотворного и святителей Кирилла и Афанасия Александрийских, которые защищали православную веру от католицизма. В 1925 году монастырь закрыли, в 2005-м вернули Русской православной церкви.
