Музей был основан еще в 1894 году по инициативе приамурского генерал-губернатора Гродекова в качестве местного отделения Русского географического общества. Среди диковинок — муляжи семейства мамонтов, изготовленные на основе их костных останков, и скелет кита-финвала, который в 1900 году в разобранном виде прибыл в музей по железной дороге из Владивостока.
Заслуживает внимания экспозиция, посвященная коренным народам Приамурья, особенно роскошное свадебное платье, другая одежда и обувь из рыбьей кожи. В новом корпусе представлена панорама «Волочаевская битва», посвященная крупному сражению времен Гражданской войны, во многом определившему судьбу Дальнего Востока. Рядом с музейным зданием установлена древняя скульптура черепахи XII века. Считается, если погладить рептилию по голове и загадать желание, оно исполнится!