Природоохранная зона была создана в 1997 году. Площадь заповедника — более 18 тысяч гектаров. На его территории расположено озеро Баскунчак — редкий бессточный соленый водоем. Также здесь находится гора Большое Богдо, которая является самой высокой точкой Прикаспийской низменности. В заповеднике встречаются редкие представители флоры и фауны, он считается важной точкой на маршруте перелетных птиц.
