Величественный белокаменный храм возводили с 1706 по 1713 год. Здание с ажурным декором в стиле барокко — одно из старейших в Иркутске — строил московский зодчий Моисей Долгих. Позже архитектурный ансамбль дополнили ярусной колокольней с наличниками. На восточном фасаде церкви сохранились росписи начала XIX века, изображающие таинство крещения, вход Иисуса Христа в реку Иордан и церемонию канонизации. В 1931 году храм закрыли и отдали под ремонтные мастерские. После реставрации во второй половине ХХ века внутри находился выставочный зал краеведческого музея. Богослужения возобновились в 2000-е годы.