На средства купца Ивана Пчелина в 1756 году был построен храм. В 1915 году при нем функционировало училище. В советское время церковь работала до 1937 года и была единственной действующей в городе. После закрытия у собора снесли колокольню и каменную ограду, настенные росписи были утрачены. В 1990-х храм отреставрировали, и с 1993 по 2016 год он являлся кафедральным собором Йошкар-Олинской и Марийской епархии. Лаконичное белое здание практически лишено декора. Постройку дополняет четырехъярусная колокольня.
